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5 Formel-Editoren
5.1 Beschreibung
Wir unterscheiden zwei Arten von Formel-Editoren:
- Software für mathematische Formelschreibweisen;
sie ist häufig als Tool bei Office-Anwendungen enthalten und findet in der
Chemie gelegentlich Anwendung (chemisches Rechnen oder Kernchemie).
- Spezifische Software für Chemiker zum zeichnen
kovalenter Molekülformeln wird häufig eingesetzt und sollte schon von
Lernenden zum Einstieg in die organische Chemie in Grundzügen beherrscht
werden.
5.2 Formel-Editoren für mathematische Anwendungen: das
Tool Microsoft Formel-Editor
Microsoft Office verfügt über ein Tool, mit dem
sich in der Chemie
- mathematische Schreibweisen (mehrfache Brüche,
Wurzel, Matritzen usw.) sowie
- die vollständige Symboldarstellung von Teilchen
realisieren lassen.
Auf mathematische Schreibweisen wird nicht näher
eingegangen.
Übung 1: Ziel ist es, die vollständige
Symbolschreibweise des Kohlenstoffisotops 12-C in der anionischen Form korrekt
darzustellen.
- Öffnen Sie PowerPoint. Entfernen Sie im neuen
Dokument die vorgegebenen Textfenster.
- Registerkarte Einfügen, Menü Text,
Objekt, neu erstellen angeklickt lassen, Microsoft
Formel-Editor 3.0 wählen. Sollten Sie in der Auswahl keine solche Option
finden, muss der Editor auf Ihrem System nachinstalliert werden.
- Dort erst Schriftart anpassen: Formatvorlage,
Definieren... Schriftarten, z.B. Arial, für Text, Funktion, Variable,
Matrix/Vektor und Zahl einstellen. Häkchen bei Variable kursiv heraus
nehmen. OK.
- Vorlagen für Hoch- und Tiefstellungen
(Mauszeiger über den Gruppen stehen lassen, dann tauchen die Bezeichnungen
auf) anklicken und das graue Symbol mit zwei schwarzen Feldern links (oben
und unten) auswählen. Es erscheinen zwei gestrichelt umrandete Felder auf
der Arbeitsfläche des Editors.
- Oben "12" (Massenzahl), unten "6" (Ordnungszahl)
eintragen.
- Hinter die Zahlen klicken und "C" eingeben.
- Vorlagen für Hoch- und Tiefstellungen
anklicken und das graue Symbol mit zwei schwarzen Feldern rechts auswählen.
Es erscheinen zwei gestrichelt umrandete Felder rechts neben dem Symbol "C".
- Oben "4-" (Ladungszahl), unten "1" (Teilchenzahl,
hier eigentlich überflüssig) eintragen.
- Datei, beenden und zurückkehren zu...
In der PowerPoint-Datei erscheint ein Objekt im Rahmen. Dabei handelt es
sich um das Ergebnis im Vektor-Format, d.h. Sie können das Feld ohne
Qualitätsverlust beliebig groß ziehen.
Das gerade erstellte Objekt lässt sich
- als gif-Folie speichern, zurecht schneiden und als
Bild in HTML-Dokumente einbinden;
- mit weiteren Objekten zu Kerngleichungen o.ä.
kombinieren; achten Sie dabei auf gleiche Endgrößen nach dem Ziehen, am
besten über das Einstellen gleicher Höhen über re Maustaste, Objekt
formatieren, Größe, in % oder cm.
5.3 Strukturformel-Editoren
Für kovalente Moleküle gibt es eine Reihe von Formel-Editoren speziell für
Chemiker:
/bilder/5_Formeleditoren.gif)
Abb.: Aktuelle Marktlage Formel-Editoren, Stand 04/13
Jedes der erwähnten Programme bietet spezifische Sonderfunktionen, die hier
nur beispielhaft gelistet werden sollen:
- 2D- in 3D-Formeln konvertieren,
- Formeln nach IUPAC benennen,
- Formeln aus IUPAC-Namen konstruieren,
- Experimentalaufbauten zeichnen,
- NMR-, MS- und/oder IR-Spektren vorhersagen,
- Formeln von gescannten Vorlagen erkennen...
Exkurs: Begriffe rund um
chemische Formeln.
Elementarformel: gibt die Art und das Zahlenverhältnis
von Atomen in einer Verbindung an. Bsp.: NaCl, CaCl2, CH2O
(Glucose!). Synonym: Verhältnisformel.
Molekülformel: gibt die Art und die Anzahl von Atomen
in einer Verbindung an. Bsp.: C6H12O6
(Glucose), C2H6O (Ethanol). Synonym, Gebrauch aber nicht
empfohlen: Summenformel.
Konstitutionsformel: gibt die Verknüpfungsart
(Konstitution) von Atomen im Molekül an, ohne jedoch die vollständige Struktur
des Moleküls aufzuzeigen. Sie sollte von der Strukturformel unterschieden
werden.
/bilder/5_essigs_konst.gif)
Konstitutionsformel für Ethansäure (Essigsäure).
Strukturformeln vermitteln in zweidimensionaler
Darstellung Informationen, die über diejenigen der Konstitutionsformeln
hinausgehen, z.B. Verknüpfungen, die sich nicht mit Konstitutionsformeln
darstellen lassen, spezielle Bindungsarten oder die räumliche Anordnung von
Atomen und Atomgruppen.
/bilder/5_essigs_konfig.gif)
Strukturformel für Ethansäure mit der Doppelbindung in der Carbonylgruppe und
der sp3-Umgebung des Methyl-C-Atoms.
Darstellungsvarianten: Elektronenformel, Valenzstrichformel,
Skelettformel, 3D-Formel. Der Begriff 3D-Formel kommt in den DIN-Normen und
IUPAC-Veröffentlichungen nicht vor. Wir bezeichnen damit
Formeldarstellungen, die:
- die exakte, statisch-räumliche Anordnung von
Atomen und Atomgruppen wiedergeben und
- es dem Betrachter ermöglichen, das Molekül von
mehreren Seiten zu betrachten.
Genau genommen ist die Darstellung nur pseudo-3D, da auf
zweidimensionalem Bildschirm nur ein 3D-Eindruck vermittelt wird.
Gängige Darstellungsformate sind: pdb (protein data base, älter und eher für
große Moleküle wie Proteine gedacht) und
JMOL (neuer, sehr vielseitig).
Essigsäure im pdb-Format,
Kugel-Stäbchen-Darstellung (Plugin nötig).
Beispiele für JMOL-Darstellungen mit Hilfe von Java finden Sie
hier.
Es folgen die Übungen 2 bis 5.
Download der Folien
als PowerPoint-Datei
E-Mail:
Walter.Wagner ät uni-bayreuth.de
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